1939年，崔琦出生在河南省平顶山市宝丰县范庄村，他从小在母亲的严格教育下成长起来。读完小学后，乡里还未建立中学，只好暂时辍学回家。在这段时间里，他曾和大姐一块到妇女学习班上担任老师，受到大家的欢迎。他还曾因为“量地”被村里人为难和夸赞。

　　村里人知道他能写会算，有时派他去跟着分地。村里的地有些是三角形、菱形，甚至不规则图形。计算这样的地块面积要费些时间，村里人计算很久才能算出，可崔琦能极快的算出来，这让村里人感到新鲜又好奇。于是村里人故意找些不好算的地块难为他，每次崔琦都能非常准确的快速计算出结果。当时，乡里有个有名的老会计听说后，有些不服气特意找了块“一杆旗”（极不规则的地块）的地让他算。等到各边数据测量出来，崔琦一口就答出结果来，经过测量计算，崔琦果然答对了。当有人问他如何算出来时，他只是微笑不答。这件传奇小事初现了崔琦儿时的聪明。

　　1951年，崔琦在亲戚家人的帮助下，到香港培正中学读书。1958年，他获得美国资助进入一所教会学校读书。后来，崔琦到芝加哥大学攻读物理学博士。有次上实验课，导师让崔琦去取螺丝刀。崔琦却发起了呆，因为他既不知道螺丝刀的型号，也不知道该如何动手做实验。这件小事极大刺激了崔琦，从中国来的科研学者居然不会使用这么简单的螺丝刀。崔琦明显的感觉的到与西方人之间的差距，这促使他只能更加卖力地专注于个人的学业。

　　除了勤奋外，崔琦还有异于他人的实验方法。别人做实验总是为了求得预期结果，这样做起来相对容易。崔琦不把预期结果看得那么重要，而是更留心观察实验过程中一些意外现象。正确方法和辛勤汗水为他日后的科学发现奠定了基础。

　　1998年10月13日，瑞典皇家科学院为表彰崔琦与另两位科学家因发现强磁场中共同相互作用的电子能形成具有分数分子电荷的新型“粒子”，授予他们三人诺贝尔物理学奖。他成为继李政道、杨振宁、丁肇中、李远哲、朱棣文之后，世界上第六位获得诺贝尔奖的华人。